Francesca Benati inizia la sua carriera nel 1988 in ambito pubblicitario. Nel 2006 passa al settore del mass market e, per più di 10 anni, lavora per prestigiose aziende multinazionali come Coca-Cola, Kellogg's, Lego Company, in ruoli di crescente responsabilità in area Marketing and Communication e di senior leadership in differenti aree di business. Nel 2007 entra a far parte del team di Expedia, dove ricopre per due anni il ruolo di Direttore Marketing e successivamente quello di Country Coordinator per la filiale italiana. Nel 2009 è Direttore della divisione digitale e di e-Commerce del Gruppo Blu Vacanze e Cisalpina, importante rete di agenzie di viaggi e tra i principali leader nel settore dei viaggi d'affari.

Dal 2010 è in lastminute.com come Amministratore Delegato per l'Italia e dal 2011 come A.D. per Italia e Spagna. Da novembre 2013 è Amministratore Delegato e Direttore Generale di Amadeus Italia. E' membro del Consiglio di Amministrazione di Netcomm (consorzio italiano di e-commerce, dove è il referente per il settore Viaggi e Turismo) dal 2009, oltre a svolgere docenze universitarie come relatore ospite ai Master di Online Travel and Tourism Management presso l'Università Commerciale Luigi Bocconi di Milano, la Libera università di lingue e comunicazione IULM di Milano e al Master MAINS: Management, Innovazione e Ingegneria dei servizi) della la Scuola Superiore di Studi Universitari e di Perfezionamento Sant'Anna di Pisa.